מרכז י.נ.ר מציע תארים ראשונים המיועדים לציבור החרדי, כולל תואר בפסיכולוגיה, מדעי החברה והרוח, ניהול וכלכלה, ומדעי המדינה. קיימת גם תכנית 'רבבה' המשלבת לימודי קודש עם תואר ראשון.
המרכז מציע מגוון רחב של תוכניות הכשרה, כגון קורס תרפיה באומנות, תכנית לטיפול בטראומה בילדים, לימודי טיפול משפחתי וזוגי, ולימודי הנחיית הורים. כמו כן, קיימים קורסים ב-CBT, טיפול בהתמכרויות וניתוח התנהגות יישומי (ABA).
כן, מרכז י.נ.ר מציע לימודי תעודה רבים, ביניהם לימודי רפואה טבעית בטיפול נפשי, קורס פסיכולוגיה יהודית, קורס NLP, וקורס ייעוץ תעסוקתי. ישנם גם קורסים להדרכת חתנים וכלות, וטיפול בטראומה.