מרכז י.נ.ר מציע תארים ראשונים בפסיכולוגיה, מדעי החברה והרוח, ניהול וכלכלה, ומדעי המדינה. קיימת תכנית ייעודית לתואר ראשון לחרדים, וכן תכנית "רבבה" המשלבת לימודי קודש עם לימודים אקדמיים. תוכניות אלו נועדו לספק השכלה אקדמית רחבה תוך התחשבות בצרכים הייחודיים של הקהילה.
המרכז מציע מגוון רחב של תוכניות הכשרה מקצועיות בתחומי הטיפול והייעוץ. בין היתר, ניתן למצוא קורסים בתרפיה באומנות, טיפול בטראומה, טיפול בהתמכרויות, ולימודי טיפול משפחתי וזוגי. כמו כן, מוצעות הכשרות בניתוח התנהגות יישומי (ABA), הנחיית הורים, CBT, וטיפול בעזרת בעלי חיים, לצד קורסים נוספים.
מדרשת רבבה היא חלק ממרכז י.נ.ר ומוזכרת בהקשר של שיעורי הכנה לחגים, כמו שיעור ההכנה לראש השנה. היא גם עומדת בבסיס "תכנית רבבה", שהיא מסלול לתואר ראשון המשלב לימודי קודש עם לימודים אקדמיים. בנוסף, המדרשה מציעה תכנים מקצועיים בשיח טיפולי, כפי שמופיע בתפריט הניווט של האתר.