הקורס להכשרת יועצי נישואין ומשפחה במרכז י.נ.ר הוא קורס ייעוצי מתקדם ברמה טיפולית גבוהה, המשלב לימודים עיוניים ומעשיים לחיזוק הבית היהודי. רכז התכנית הוא הרב אביחי שלום כהן. זוהי מסגרת הכשרה ייחודית המיועדת לאנשי חינוך וקהילה, בעלי תואר ראשון ושני, עוסי״ם ומטפלים רגשיים, המעוניינים להפוך ליועצים מקצועיים, מודרכים ופועלים מתוך מסגרת אתית. הקורס מתמקד ביצירת מצב שבו זוגות החפצים בעזרה יגיעו לאיש מקצוע ללא פשרות מקצועיות, אתיות והלכתיות, תוך שילוב רגישות להשקפת עולם תורנית והתנהלות מקצועית מבוססת מחקר וספרות. הלמידה בקורס אינה תיאורטית קרה, אלא מנגישה תיאוריות באופן אישי וחווייתי, בליווי צוות מקצועי. תהליך הקבלה כולל ראיונות לוודא התאמה לתחום, וההכשרה כוללת יחידות לימוד על תורת הנפש של היחיד והזוג, שלבי התפתחות התא הזוגי והמשפחתי, אתיקה משפטית, דילמות הלכתיות, זיהוי והתמודדות עם הפרעות בחיי אישות, ומצבים פסיכיאטריים ואלימות. התלמידים נחשפים לעקרונות טיפוליים, רוכשים הבנה במודלים מבוססי מחקר, מתרגלים סימולציות ומקבלים ליווי הדרכתי מצוות מדריכים רחב.